• 黃崇哲不尊重部門主管職權，直接指揮同仁，針對不為其所喜好主管，則架空其職權或撤換，並鼓勵密報，提拔拍馬屁、告密者。假借組織改造名義，行累積潛規則籌碼之實、破壞原本簡單效率的扁平化組織，除拉下不喜歡的主管外，增設一到兩級不必要之主管職位，增加主管職務加給支出，藉此拉拔親信升官發財，就是官變多了!徒增基層同仁工作負擔。 安排其國小同學、同鄉在院內部門任職，該員雖是業務助理卻仗黃崇哲之勢在部門就像地下主管一樣，連主管都懼他三分。授意某平時就會向其示好的某張姓同仁於上、下班時間擔任他兒子黃正宇家教(黃正宇於後考上建國中學)，而這個同仁先升任副所長，後續更在「組織改造」後，榮升所長!